Die Pfadi Lindegar ist als gemeinnütziger Verein gemäss Art. 60 ff. ZGB organisiert und bildet eine lokale Abteilung der Pfadibewegung Schweiz und des Kantonalverbands Pfadi Luzern. Die Pfadi Lindegar ist des Weiteren teil des Corps Luleu, der auf regionaler Ebene Anlässe für die Abteilungen in der Stadt Luzern organisiert.
Die organisatorische Struktur der Abteilung ist so aufgebaut, dass operative und strategische Aufgaben klar getrennt sind. Dadurch wird sichergestellt, dass die Leitenden sich auf die Durchführung der Aktivitäten konzentrieren können, während übergeordnete Aufgaben koordiniert und unterstützt werden.
Die operative Leitung nimmt die Abteilungsleitung wahr, während die strategische Führung des Vereins durch den Vorstand sichergestellt wird.
Die Pfadi Lindegar wird des Weiteren durch einen J+S Coach unterstützt, der besonders für die Planung der diversen Lager eine grosse Stütze ist. Ausserdem bekommen wir durch die Pfarrei St. Leodegar einen Präses zur Verfügung gestellt, der unsere Abteilung begleitet und unterstützt.